Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms