Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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