Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms