Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CPS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms