Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim11Q99PQ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim11Q99PQ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms