Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP9

Trim16, Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16Q99PP9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim16Q99PP9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim16Q99PP9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms