Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdh23Q99PF4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms