Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab27bQ99P58 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab27bQ99P58 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab27bQ99P58 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab27bQ99P58 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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