Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atoh8Q99NA2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms