Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Mrpl3Q99N95 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl3Q99N95 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl3Q99N95 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl3Q99N95 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl3Q99N95 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl3Q99N95 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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