Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms