Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf17Q99MV7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf17Q99MV7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms