Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms