Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh4Q99MT2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms