Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtpbp4Q99ME9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms