Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms