Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q99M08 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q99M08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q99M08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q99M08 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q99M08 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms