Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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