Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms