Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd3Q99LE3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms