Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SardhQ99LB7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms