Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms