Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms