Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf19Q99KP6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms