Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rab28Q99KL7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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