Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms