Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp11Q99K46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms