Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms