Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms