Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms