Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8b1Q925Q3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms