Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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