Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf144aQ925F3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf144aQ925F3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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