Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbox1Q924Y0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms