Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk3Q924C5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alpk3Q924C5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms