Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ferd3lQ923Z4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms