Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms