Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms