Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TardbpQ921F2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TardbpQ921F2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms