Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms