Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms