Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6cQ91ZQ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pde6cQ91ZQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms