Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl3Q91YH5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms