Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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