Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms