Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms