Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms