Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmx1Q8VBT0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmx1Q8VBT0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms