Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms