Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8R3C1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms